Op de bovengalerij tegen de westelijke muur  staat het zogenoemde Knipscheerorgel. H. Knipscheer ( van de tweede generatie die het orgelbedrijf  tot bloei bracht) bouwde in  de vorige kerk in 1851 een balustrade -orgel.. Als decoratie zijn een drietal beeldjes boven het orgel aangebracht. Boven alles uit torent Koning David met de onafscheidelijke harp. Deze afbeelding verwijst naar de componerende en psalmenschrijvende David die op een luit zijn geloofsvragen al zingende muzikaal vertolkte ( Psalm 150 e.a.). Links en  rechts van  dit beeld bevinden zich twee fluitende  engelfiguren.

Het orgel heeft de volgende registers:  3 prestantstemmen ( 8, 4 en 2 voets lengte),

een 3-4 korige Mixtuur ( vanaf 2 voets lengte), een 5 stems Cornet, een Bourdon 8 voets lengte, een Quint 3 voets lengte  en een aangehangen pedaal. Het orgel is in 1979-1980 gerestaureerd door de firma Leeflang te Apeldoorn en thans in onderhoud bij de firma Flentrop uit Zaandam. In 2007 is dit markante orgel met zijn heldere en opgewekte klanken opnieuw grondig gerestaureerd. Een restauratie die door de volgende sponsors mogelijk is gemaakt:

1. St.Bijstand Restauratiekosten Monumenten Hervormde Gemeente Amsterdam
2. St. Maatschappij van Welstand
3. St. Orgelfonds Mooy
4. St.Vrienden van de Sloterkerk
5. St. W.J.O. de Vriesfonds (Kasbank)
6. 'Stichting tot behoud van het nederlandse orgel' uit Elburg